专家介绍
蓝馨
优势擅长
1. ATE1的分子机制研究
通过结构、生化和细胞相关实验，多维度解析 ATE1 的催化机制及分子作用特征。
进行 ATE1 蛋白及其突变体的体外表达与纯化，参与冷冻电镜样品制备与成像，掌握复合物样品的处理与制备流程。
开展 ATE1 与tRNA 结合、ATE1二聚体形成等生化互作实验，解析底物识别的分子基础。
重构体内精氨酸化反应体系，研究ATE1异构体的催化活性与底物偏好。
构建 ATE1 的敲除与过表达模型，用于转录组、蛋白组及互作组学样本的制备与基础分析，评估ATE1改变后的分子层面响应。
2. ASXL–MBD 复合体的结构基础研究
参与 ASXL 与 MBD 结构域的蛋白制备，从分子层面分析两者的结合特征。
负责 ASXL 与 MBD 结构域的表达、亲和纯化，获得可用于结构研究的高纯度蛋白样品。
通过 HPLC、NMR 滴定等实验评估复合体的结合模式与相互作用特征。
负责复合体制备，用于3D NMR 分析与结晶筛选，推进高分辨率结构获取的工作。
开展 MBD 与 RNA 的生化结合实验，探索其潜在的分子识别特征。
3. tRNA 编辑酶介导的 mRNA 修饰研究
开展 A-to-I RNA 编辑的底物识别机制研究，关注 tRNA 编辑酶在特定结构背景下的潜在 mRNA 编辑作用。
负责编辑酶的蛋白表达与纯化，搭建体外反应体系并通过 RT-PCR/Sanger评估编辑事件。
在细胞模型中进行过表达与敲低实验，检测候选位点的编辑情况。
参与扩增子测序方案的设计，包括多位点引物设计与批量扩增流程，用于高通量检测RNA修饰或序列变化。
科研成果
科研技能： 1. 出生缺陷与细胞、分子遗传学技能 曾在威海市出生缺陷防控重点实验室见习，系统学习了细胞遗传学相关知识与实验技术，熟练掌握染色体核型分析及孕妇外周血胎儿游离 DNA检测的标准实验流程。 2. 博士阶段科研技能 （1）分子生物学技术 熟练掌握 PCR、RT-PCR、qPCR 扩增体系搭建、引物设计及扩增条件优化；掌握分子克隆、载体构建、突变体制备等流程；熟悉扩增子测序样本制备与批量扩增流程。 （2）蛋白质与结构生物学技术 系统掌握重组蛋白的表达与纯化、蛋白相互作用的体外分析方法；熟悉冷冻电镜样品制备流程，掌握基础 NMR 滴定与蛋白结晶技术。 （3）细胞与基因操作技术 掌握慢病毒包装、稳定细胞系构建流程，具备基因敲除、过表达模型构建及细胞表型分析经验。 （4）组学相关与数据分析 掌握转录组、蛋白组及互作组等组学样本的制备方法与流程，具备高通量组学数据分析及后续分子机制研究的能力。 发表论文： 1. Abeywansha, T., Huang, W., Ye, X., Nawrocki, A., Lan, X., Jankowsky, E., Taylor, D. J., & Zhang, Y. (2023). The structural basis of tRNA recognition by arginyl-tRNA-protein transferase. Nature communications, 14(1), 2232. (IF= 15.7) 2. Lan, X., Huang, W., Kim, S. B., Fu, D., Abeywansha, T., Lou, J., Balamurugan, U., Kwon, Y. T., Ji, C. H., Taylor, D. J., & Zhang, Y. (2024). Oligomerization and a distinct tRNA-binding loop are important regulators of human arginyl-transferase function. Nature communications, 15(1), 6350. (IF= 15.7) 3. Lin, Z., Xie, Y., Gongora, J., Liu, X., Zahn, E., Palai, B. B., Ramirez, D., Searfoss, R. M., Vitorino, F. N., Dann, G. P., Zhao, C., Han, X., MacTaggart, B., Lan, X., Fu, D., Greenberg, L., Zhang, Y., Lavine, K. J., Greenberg, M. J., Lv, D., … Garcia, B. A. (2025) An unbiased proteomic platform for activity-based arginylation profiling. Nature chemical biology. (Accepted) (IF=13.7) 4. Kim, S. B., Lee, J. S., Lan, X., Huang, W., Taylor, D. J., Kwon, Y. T., Zhang, Y., & Ji, C. H. (2025). The structure-function relationship of ATE1 R-transferase of the autophagic Arg/N-degron pathway. Autophagy, 1–3. Advance online publication. (IF=14.3) 5. Lan, X., Lee, D., Zhang, Y. (2025) In-bacteria arginylation assay. Methods in enzymology. (Book chapter) 6. Lan, X., Searfoss, R. M., Lee, D., Bhaskaran, S., Abeywansha, T., Garcia, B. A., Lin, Z., & Zhang, Y. (2025) Reconstitution of protein arginylation pathways in bacteria for robust identification and quantification. Communications Biology. (IF=5.2)
